華為G9Plus采用3D指紋識別技術，3D識別速度相比上一代提升一倍，準確率提升15%。普通2D的指紋信息采集平面信息，華為G9Plus可以采集Level 4的3D指紋信息，包含手指指紋的高度信息，就是在指紋脊線與谷線之間的高度信息，進一步提高指紋識別的安全性。
華為G9Plus可以做到360度解鎖，也就是說在各個角度下0度：99.5%；45度：99.3%；90度：99.5%，都能達到優秀指紋識別水平，整體的正常手指主觀解鎖率方面變現出色。
指紋識別加入更多玩法
指紋安全對于手機用戶來說變得越來越重要，因為2D的指紋信息采集平面信息很容易被復制，從而造成財產和隱私的安全性降低；華為G9Plus加入安全算法，level1全局特征，level2局部脊線特征，level3脊線細節特征，level4 3d 指紋采集(防偽，立體的指紋信息)，這將有效保護手機安全。
華為G9Plus在指紋識別按鍵上加入了更多的玩法，如：上下滑動指紋可下拉或隱藏手機通知、左右翻圖片、支持長按拍照、長按接聽電話、長按關閉鬧鐘等功能設置。
支持支付寶、華為Pay、京東錢包指紋支付
華為G9Plus的指紋識別支持自學習功能，首次錄入指紋后，在用戶使用的過程中，自動檢測更加指紋，提升指紋識別的成功率；此外，支持熄屏下按特定手指直接進入支付寶支付界面；在國內，支持支付寶、華為Pay、京東錢包指紋支付。
