摩托羅拉XT390使用了時下流行的Android2.3操作系統。這一版本在穩定性和兼容性上都極為出色，并且具有多于10萬個的海量應用程序可供用戶使用。摩托羅拉XT390對于系統進行了二次開發，使用了最新版本的MotoSwitch個性化界面。該機的解鎖界面非常有特點。解鎖圖標被信息、通話、拍照和情景模式等四個常見的功能圖標所包圍。用戶點擊解鎖圖標并將其拖動出圓圈即可解鎖。若需要快速開啟其他功能，則將其圖標拖動到圓圈中央即可。
摩托羅拉XT390采用了“七分屏”，最多可增加至9個分屏。屏幕底座設置了四個快捷圖標，除最右側的Home鍵不可替換外，其余三個都可替換成其他快捷圖標。
MotoSwitch界面保持了Andorid系統應用使用最頻繁的下拉菜單功能。該下拉菜單分為三部分：上部為近期任務;中部為正在進行的任務;下部為通知。能夠清楚表明手機所處的狀態以及需要處理的事情。同時，該界面也支持常見的插件添加功能。對于使用過Android手機的朋友來說，這一功能相信已經十分熟悉。
摩托羅拉XT390的菜單界面采用4行×4列的格式排列。整體顯得十分的整潔，美觀。并可根據不同類別進行分類顯示。當然用戶可以隨意新建群組，進行個性化分類，方便用戶查找和使用應用程序。
