酷派9900在系統方面也進行了升級，采用的是酷派自主研發的智囊4.0操作系統，它是基于Android系統開發的，全新的智囊4.0在界面和功能上進行了非常深入的升級，例如桌面增加了CoolRouter（資訊推送）和CoolFans（社交網絡）插件。
酷派9900的界面
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5英寸1.5GHz雙核新旗艦 酷派9900上手玩 張浩  手機中國  2011-11-21
智囊4.0新系統UI
酷派9900在系統方面也進行了升級，采用的是酷派自主研發的智囊4.0操作系統，它是基于Android系統開發的，全新的智囊4.0在界面和功能上進行了非常深入的升級，例如桌面增加了CoolRouter（資訊推送）和CoolFans（社交網絡）插件。
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